HAI CHỦNG VI TẢO Scenedesmus sp. MỚI ĐƯỢC PHÂN LẬP TỪ KHU DỰ TRỮ SINH QUYỂN RỪNG NGẬP MẶN CẦN GIỜ VÀ ĐỊNH DANH DỰA TRÊN TRÌNH TỰ 18S
Nội dung chính của bài viết
Tóm tắt
Vi tảo Scenedesmus thuộc ngành Chlorophyta là một trong những loài tảo nước ngọt được phân bố rộng khắp trên thế giới. Nhiều loài vi tảo thuộc chi Scenedesmus xuất hiện và đóng vai trò quan trọng trong môi trường nước ở khu dự trữ sinh quyển rừng ngập mặn Cần Giờ. Trong nghiên cứu này, hai chủng vi tảo được làm thuần, Scenedesmus CG01 và CG03, đã được phân phân lập mới từ hai vị trí thu mẫu khác nhau ở khu dự trữ sinh quyển rừng ngập mặn Cần Giờ. Hai chủng vi tảo này có đặc điểm hình thái giống nhau và điển hình của chi Scenedesmus. Kết quả PCR, giải trình tự và định danh dựa trên trình tự DNA 18S giúp xác định 2 chủng CG01 và CG03 này là Scenedesmus sp. Trình tự DNA của 2 chủng này có một số điểm khác biệt so với trình tự DNA tương ứng của Scenedesmus sp. CCAP 217/7 và CCAP217/8 trong ngân hàng gene. Cây phát sinh loài dựa trên trình tự 18S cho thấy hai chủng CG01 và CG03 ở một nhóm tách biệt với các mẫu còn lại. Các nghiên cứu phân lập và định danh chính xác tên loài cung cấp cơ sở quan trọng trong các nghiên cứu ứng dụng vi tảo tiếp theo sau.
Từ khóa
18S, Cần Giờ, Scenedesmus
Chi tiết bài viết
Tài liệu tham khảo
Assunção, J., Pagels, F., & Guedes, A. C. (2023). Algae biorefinery: Strategies for a sustainable industry. In Algae materials: Applications benefitting health (pp. 399-433). Elsevier.
https://doi.org/10.1016/B978-0-443-18816-9.00020-4
Baudelet, P. H., Ricochon, G., Linder, M., & Muniglia, L. (2017). A new insight into cell walls of Chlorophyta. Algal Research, 25, 333-371. https://doi.org/10.1016/J.ALGAL.2017.04.008
Canter-Lund, H., & Lund, J. W. G. (1995). Freshwater algae: Their microscopic world explored. Biopress. https://doi.org/10.2216/i0031-8884-35-4-372b.1
Colla, E., Kalschne, D. L., da Silva-Buzanello, R. A., Canan, C., Drunkler, D. A., & Menegotto, A. L. L. (2020). Microalgae: A new and promising source of food. In Handbook of algal science, technology and medicine (pp. 507-518). Academic Press.
DOI: https://doi.org/10.1016/B978-0-12-818305-2.00032-2
Culture Collection of Algae and Protozoa (CCAP). (n.d.). Homepage. Retrieved May 1, 2024, from https://www.ccap.ac.uk/
Fawley, M. W., & Fawley, K. P. (2020). Identification of eukaryotic microalgal strains. Journal of Applied Phycology, 32(5), 2699-2709. https://doi.org/10.1007/s10811-020-02190-5
Fernandez-Valenzuela, S., Chávez-Ruvalcaba, F., Beltran-Rocha, J. C., San Claudio, P. M., & Reyna-Martínez, R. (2021). Isolation and Culturing Axenic Microalgae: Mini–Review. The Open Microbiology Journal, 15(1), 111-119. https://doi.org/10.2174/1874285802115010111
Gross, O. P. W. (2004). Valuable products from biotechnology of microalgae. Appl Microbiol Biotechnol, 65, 635-648. https://doi.org/10.1007/s00253-004-1647-x
Janse van Vuuren, S. (2006). Easy identification of the most common freshwater algae. A guide for the identification of microscopic algae in South African freshwaters.
Maltsev, Y. I., & Konovalenko, T. V. (2017). New finding of green algae with potential for algal biotechnology, Chlorococcum oleofaciens and its molecular investigation. Regulatory Mechanisms in Biosystems, 8(4), 532-539. https://doi.org/10.15421/021782
Nucleotide BLAST: Search nucleotide databases using a nucleotide query. (n.d.). Retrieved May 1, 2024, from https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&PAGE_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome
Pham, T. L. (2017). Environmental gradients regulate the spatio-temporal variability of phytoplankton assemblages in the Can Gio Mangrove Biosphere Reserve, Vietnam. Ocean Science Journal, 52(4), 537-547. https://doi.org/10.1007/s12601-017-0045-0
Scenedesmus. (n.d.). Retrieved May 29, 2024, from https://fmp.conncoll.edu/Silicasecchidisk/LucidKeys3.5/Keys_v3.5/Carolina35_Key/Media/Html/Scenedesmus_Ecology.html